Nakon Tuđmanove smrti i poraza HDZ-a na parlamentarnim izborima 200. godine, s Matom Granićem i još nekim nezadovoljnim članovima HDZ-a osniva Demokratski centar. Na čelu te stranke bila je od 2003. do 2016. godine, a otad više nije bila niti u jednoj političkoj stranci. U tri je navrata bila zastupnica u Hrvatskom saboru. Godine 2003. imenovana je ministricom pravosuđa u prvoj Vladi Ive Sanadera. U Sanaderovoj vladi započela je reformu pravosuđa, što je bio jedan od uvjeta za ulazak Hrvatske u EU. No, koncem 2005. godine sukobila se sa Sanaderom oko strategije borbe protiv korupcije. Između ostalog, nije htjela odbiti zahtjev bivših vlasnika za povratom stana u kući u Kozarčevoj ulici u Zagrebu koju je Sanader kupio. Početkom 2006. smijenjena je s dužnosti ministrice pravosuđa.