Obje vrste brašna dobivaju se iz pšenice i bogata su mineralima, vitaminima, vlaknima, itd. No, razlika koja dijeli ove dvije nutritivne namirnice je sama proizvodnja.
Prilikom proizvodnje integralnog brašna, koristi se cjelovito zrno, a prilikom proizvodnje crnog kruha koristi se samo klice i mekinje pa samim time nastaje brašno koje ima grublju strukturu i tamniju boju.
Osim proizvodnje, razlika je i u primjeni. Integralno brašno ima nešto širu primjenu pa se ono može koristiti za kruh, peciva, palačinke, itd. Crno brašno se najviše koristi za kruh i peciva te ih ujedno ono održava duže svježima.