Pogo��en je grad Mocoa, središte okruga Putumayo, u kojem živi 40.000 ljudi.
"Zadnja bilanca je 154 mrtvih", rekao je kolumbijski predsjednik Juan Manuel Santos, koji je posjetio mjesto nesreće i proglasio stanje elementarne nepogode kako bi se ubrzalo slanje pomoći.
Crveni križ procjenjuje da je oko 400 ljudi ozlijeđeno, a 220 smatra se nestalima.
Katastrofa se dogodila u noći na subotu, pola sata prije ponoći. Zbog jakih kiša izlile su se tri rijeke.
Voda, blato i kamenje odnijeli su kuće, vozila, drveće i najmanje dva mosta, objavila je vojska, koja sudjeluje u spašavanju.
Jake kiše izazvane El Ninom već nekoliko tjedana padaju na području Anda, na sjeverozapadu Latinske Amerike.
Izazvale su poplave i u Peruu, gdje je do sada poginula 101 osoba, a više od 900.000 ljudi je pogođeno, dok je u Ekvadoru poginula 21 osoba i 1280 je pogođeno.
"Situacija u Mocoi je dramatična. Pozivamo na solidarnost cijelu Kolumbiju", poručio je na Twitteru zamjenik ministra unutarnjih poslova Guillermo Rivera.
"Ovo je nezapamćena tragedija, nemamo vijesti o stotinama obitelji, cijele četvrti su pod blatom", rekao je guverner okruga Putumayo, Sorrel Aroca, za W Radio.
Pogođeno je najmanje 300 obitelji, procjenjuju vlasti.
