Prema Crvenoj knjizi vaskularne flore Hrvatske iz 2005.u koju se upisuju ugrožene životinje na području Istre, zabilježeno je 85 rijetkih i ugroženih biljnih vrsta.

Kritično ugroženim svojtama smatraju se lukovičav repak, pustenasti jarmen, žabnjačka kornjačica, kopljastolisni zvinčac, pješčarski ladolež (Calystegia soldanella), vodena slatka trava, uskolisni slak (Convolvulus lineatus), jednoplevična jezernica (Eleocharis uniglumis), žućkastobijela kukavičica (Lathyrus ochrus), troperkasta vrbica (Lythrum tribracteatum), sitna mišorepka (Myosurus minimus), zimski jednolist (Ophioglossum lusitanicum), zavinutobodljasti mak (Papaver hybridum), morska brula (Triglochin maritimum), močvarna brula (Triglochin palustris) i crljena sapunika (Vaccaria hispanica). 

U Istarskoj se županiji nalaze 33 zaštićena područja na površini od 22080,19ha, što čini 7,82% područja Županije. Najveći su Nacionalni park Brijuni i Park prirode Učka.  Ugrožene ili rijetke divlje svojte proglašava zaštićenim ili strogo zaštićenim svojtama Ministarstvo kulture pravilnikom na prijedlog Državnog zavoda za zaštitu prirode temeljem procjene ugroženosti pojedinih svojti i obveza koje proizlaze iz međunarodnih ugovora kojih je RH stranka i koji su na snazi. Zavičajne udomaćene svojte koje su ugrožene utvrđuje i proglašava zaštićenim zavičajnim udomaćenim svojtama ministar na prijedlog Državnog zavoda za zaštitu prirode.

Ugrožene životinje Istre su i dalje dio naše faune, kao i svojte biljaka, životinja i gljiva koje se procjenjuju se prema standardiziranim kriterijima koje je propisala svjetska udruga za zaštitu prirode ( International Union for Conservation of Nature , IUCN). Temeljem takve procjene izrađuju se tzv. crveni popisi i crvene knjige. 

Zavičajne udomaćene svojte između kojih su ugrožene životinje Istre utvrđuje i proglašava zaštićenim zavičajnim udomaćenim svojtama ministar na prijedlog Državnog zavoda za zaštitu prirode.