Za incident su bili krivi djelatnici zračne luke u Kairu Na trup aviona napisali su "oborit ćemo ovaj zrakoplov". Neki su radnici također napisali i 'izdajnik' i 'ubojica'. Poruke su bile usmjerene egipatskom predsjedniku Abdelu Fataha al-Sisiju – te ujedno igra riječima obzirom na fonetsku sličnost zadnja dva slova u registraciji zrakoplova SU-GCC i prezimena vođe, prenosi Daily Mail.
Napad se tada nije povezivao s džihadistima nego nestabilnom političkom situacijom. Prema neimenovanim dužnosnicima u zračnoj luci, napad je bio rezultat prosvjeda i nemira koju su poharali zemlju kada bivši general el-Sisi protjerao izabranog predsjednika Mohameda Mursija 2013. zbog jačanja radikalnog islama.
Od tada, postrožene su sigurnosne mjere zračne luke - uključujući pretraživanja posade te otpuštanje radnika s ekstremnim političkim stavovima. EgyptAir je povećao i broj nenaoružanih zaštitara koji sjede među putnicima na letovima - tri od kojih je ubijeno u letu MS804 tragedije.
Iako su se počele pojavljivati informacije o posljednjim trenucima leta, egipatske vlasti kažu da je još uvijek prerano ustvrditi definitivan uzrok nesreće.
