Prema pisanju Radio televizije Srbije koja se poziva na izvještaj dokumentacijsko-informacijskog centra Veritas, Đukić je uhićen zbog optužbe da je kao zapovjednik 221. Motorizirane brigade 9. kninskog korpusa JNA odgovoran za rušenje brane na hidroelektrani Peruća.
Optuženi Mladić, Novaković i Korica
Optužnicom su još obuhvaćeni zapovjednik 9. kninskog korpusa JNA Ratko Mladić, zapovjednik Srpske vojske Krajine Mile Novaković i zapovjednik svih pograničnih jedinica Milicije RSK Milan Korica. Svim optuženima je 1993. određen pritvor i za njima je raspisana tjeralica koja je još uvijek na snazi.
Optužnicom iz 1995. oni se terete za ratni zločin protiv civilnog stanovništva počinjen u siječnju 1993. godine.
Generali Mladić i Novaković izdali su 28. siječnja 1993. nalog Đukiću i Korici, a oni svojim podređenima, da se postavi velika količina eksploziva i tako brana na Perući pripremi za rušenje. Bila je to odmazda za oslobođenje Maslenice. Postavljeno je oko 30 tona eksploziva, nakon čega su nalogodavci povukli svoju vojsku s tog područja, a eksploziv je potom aktiviran induktorom i detonirajućim štapinima.
Eksploziv je srećom samo oštetio branu
Zbog eksplozije je došlo do urušavanja i oštećenja brane, odnosno rušenja tornja na njoj. Zahvaljujući pravremenoj intervenciji radnika Hidroelektrane "Peruća", spriječen je cilj rušenja brane – potpuno potapanje i dovođenje u opasnost života više od 50.000 stanovnika Sinja, Trilja i Omiša.
Hrvatsko Državno Odvjetništvo poslalo je, među ostalim, i optužnicu protiv Borislava Đukića i drugih Ministarstvu pravde Srbije prije dvije godine.
Tužiteljstvo je protiv ove grupe optuženika otovrilo istragu 1993. godine te podignulo optužnicu 13. prosinca 1995.. Postupak se vodi pred Županijskim sudom u Splitu.
