Drugi krug izbora trebao bi biti održan 08. listopada.
Jugoslavenska oporba, koja je već bila proglasila svoju pobjedu na predsjedničkim izborima, održanim u nedjelju 24. rujna, smatra objavu izborne komisije "velikom prijevarom" i najavljuje da neće prihvatiti održavanje drugog izbornog kruga. Oporba je pozvala svoje pristaše da izađu na ulice ako vlast ne prizna Miloševićev poraz.
Oporbeni čelnik Zoran Đinđić izjavio je da je riječ o krivotvorenju rezultata. - No, imamo čvrste dokaze o pobjedi u našim rukama i braniti ćemo volju naroda do kraja - rekao je Đinđić. Glasnogovornik DOS-a Čedomir Jovanović rekao je da nakon prebrojavanja 95,5 posto glasova postalo jasno da je pobjednik Vojislav Koštunica s 54,7 posto osvojenih glasova, dok je Slobodan Milošević dobio 35 posto glasova.
Podaci koje su objavili izvori bliski Miloševiću, bazirani na trećini prebrojanih glasova, davali su tijesnu prednost aktualnom jugoslavenskom predsjedniku. U Crnoj Gori, gdje je odziv glasača bio vrlo slab (oko 28 posto), Milošević je odnio 90 posto glasova.