Fobos je tijekom povijesti istraživanja svemira nadahnuo mnoge znanstvenike na spekuliranje. Njegov neobični način kretanja oko Marsa i druga obilježja čine ga vrlo posebnim, a jedno od objašnjenja koje su znanstvenici nudili kako bi objasnili njegovu posebnost jest da je šupalj.
Tu je teoriju iznio ruski astrofizičar Josif Šklovski, no teoretičari su opovrgnuli njegovu tvrdnju. Ipak, kasnije je utvrđeno da je možda ipak bio djelomično u pravu jer se čini da je oko 25 do 35 posto unutrašnjosti Fobosa zbilja šuplje.
Unatoč trudu znanstvenika da istraže tajanstveni mjesec, za sada je svaki pokušaj propao i to svaki put pod sumnjivim okolnostima. Zbog toga su sve glasniji oni koji tvrde da Fobos nije prirodni satelit Marsa već postaja izvanzemaljskih sila koje žele ostati neotkrivene.
Ovu je teoriju nadahnuo slučaj sonde koju su Rusi lansirali 1989., a koja je trebala sletjeli na Fobos. Nakon neuspješnog slijetanja i pregledavanja snimki koje je sonda uspjela zabilježiti, primijećena je letjelica nepoznatog podrijetla, trenutak prije nego je prestao svaki kontakt.
Na žalost, do danas još uvijek nije provedena niti jedna uspješna misija na Fobos pa ne postoje čvrsti dokazi koji bi potvrdili bilo koju od više i manje ludih teorija koje kruže o tajanstvenom mjesecu.