Ostalo je upamćeno da je tijekom boravka u Interu imao potpuno nesređeni odnos s tadašnjim trenerom Joseom Mourinhom. Portugalac je često kažnjavao Balotellija, tjerao ga iz momčadi, slao na tribinu.

"To je bio samo njegov problem", rekao je u razgovoru za BBC Balotelli osvrčući se na odnos s Mourinhom.

"Mourinho je odličan trener, ali definitivno me nije razumio. Znao mi je govoriti kako sam ja neshvaćen za sve, ali zapravo me samo on nije mogao razumjeti.

Dodao je Balotelli:

"Ne sviđa mi se kada ljudi u paketu govore o meni kao nogometašu i osobi izvan travnjaka. Ja imam izvan nogometa život kakav imam i to je moja osobna stvar. Neka me ljudi komentiraju s obzirom na ono što vide na travnjaku", završio je Balotelli.