Bio je predsjednik Srbije u vremenu od 1989. do 1997. godine te predsjednik Republike Jugoslavije od 1997. do 2000. godine. Krajem 1980-tih bio je šef Saveza komunista Srbije, a od 1990. Socijalističke partije Srbije, stranke koju je tada osnovao kao sljednicu SK Srbije.
Zločin bez kazne
Zbog pokušaja da onemogući pobjedu oporbenog kandidata Vojislava Koštunice na izborima za predsjednika SR Jugoslavije u rujnu 2000. godine Milošević je izazvao revolt i masovnu pobunu građana. To, kao i prethodno podignuta optužnica u Haagu označili su početka kraja njegove vladavine. Uhićen je 1. travnja 2001. i izručen haškom sudu 28. lipnja iste godine.
Bio je optužen za ratne zločine, genocid i zločine protiv čovječnosti u Bosni i Hercegovini, Hrvatskoj i na Kosovu tijekom 1990-tih.
U Haagu mu je suđeno pet godina, no zbog smrti proces je završio bez presude.